Enzyme sind Biokatalysatoren, die chemische Prozesse in Gang setzen. Sie bestehen meist aus Proteinen und haben bedeutende Funktionen im Stoffwechsel.
Die Verdauungsenzyme sind enthalten im Magensaft (Pepsin für die Eiweißspaltung) und Bauchspeichel (Trypsin für die Eiweißspaltung, Amylase für die Stärkespaltung, Lipase für die Fettspaltung). In der Dünndarmschleimhaut sind außerdem Disaccharidasen (Kohlenhydratspaltung), Maltase sowie Di- und Tripeptidasen (Eiweißspaltung) ansässig.
Im Dickdarm spielen vor allem bakteriell gebildete Verdauungsenzyme eine wichtige Rolle.
Eine Besonderheit beim Pferd stellt die Milchzuckerspaltung durch Laktase dar. Die Laktaseaktivität ist im Fohlenalter noch stark ausgeprägt, geh aber immer weiter zurück, sodass ein adultes Pferd keine Laktose mehr spalten kann.